Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAV1Q03135 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CAV1Q03135 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms