Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
MS4A2Q01362 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms