Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDK16Q00536 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CDK16Q00536 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms