Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
EEF1A1P68104 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms