Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GNB1P62873 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GNB1P62873 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GNB1P62873 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GNB1P62873 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GNB1P62873 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms