Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPS25P62851 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPS25P62851 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPS25P62851 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPS25P62851 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS25P62851 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS25P62851 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS25P62851 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS25P62851 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPS25P62851 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS25P62851 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS25P62851 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS25P62851 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPS25P62851 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms