Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSCP56915 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSCP56915 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GSCP56915 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSCP56915 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSCP56915 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSCP56915 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSCP56915 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSCP56915 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSCP56915 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSCP56915 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSCP56915 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GSCP56915 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms