Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAD23AP54725 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms