Protein–RNA interactions for Protein: P53314

CPD1, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPD1P53314 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.91□□□□□ -2.26
CPD1P53314 KAP120YPL125W 3099 nt0.91□□□□□ -2.26
CPD1P53314 DIE2YGR227W 1578 nt0.91□□□□□ -2.26
CPD1P53314 BEM2YER155C 6504 nt0.9□□□□□ -2.26
CPD1P53314 MMS4YBR098W 2076 nt0.9□□□□□ -2.26
CPD1P53314 SLI15YBR156C 2097 nt0.9□□□□□ -2.26
CPD1P53314 NPC2YDL046W 522 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YLR287CYLR287C 1068 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YML003WYML003W 873 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 SPO75YLL005C 2607 nt0.9□□□□□ -2.27
CPD1P53314 STO1YMR125W 2586 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 PDE2YOR360C 1581 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 RTT102YGR275W 474 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 IRC23YOR044W 474 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YOR199WYOR199W 330 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 LOA1YPR139C 903 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 FIG4YNL325C 2640 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 SPT7YBR081C 3999 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 SIP4YJL089W 2490 nt0.89□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YJR003CYJR003C 1560 nt0.88□□□□□ -2.27
CPD1P53314 ZIP2YGL249W 2115 nt0.88□□□□□ -2.27
CPD1P53314 SLD3YGL113W 2007 nt0.88□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.88□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YLR101CYLR101C 396 nt0.88□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.88□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.88□□□□□ -2.27
CPD1P53314 SCC2YDR180W 4482 nt0.88□□□□□ -2.27
CPD1P53314 TTI1YKL033W 3117 nt0.88□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YER006C-AYER006C-A 318 nt0.86□□□□□ -2.27
CPD1P53314 AIM9YER080W 1884 nt0.86□□□□□ -2.27
CPD1P53314 DOP1YDR141C 5097 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 IML1YJR138W 4755 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 COG4YPR105C 2586 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YJL135WYJL135W 318 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 UBC7YMR022W 498 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 TOM22YNL131W 459 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 ATP19YOL077W-A 207 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YPL261CYPL261C 309 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 PAN2YGL094C 3348 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YDL206WYDL206W 2289 nt0.85□□□□□ -2.27
CPD1P53314 CBS1YDL069C 690 nt0.84□□□□□ -2.27
CPD1P53314 YPL229WYPL229W 621 nt0.84□□□□□ -2.27
CPD1P53314 snR41snR41 95 nt0.84□□□□□ -2.27
CPD1P53314 HCH1YNL281W 462 nt0.83□□□□□ -2.28
CPD1P53314 YOL160WYOL160W 342 nt0.83□□□□□ -2.28
CPD1P53314 RPB10YOR210W 213 nt0.83□□□□□ -2.28
CPD1P53314 IFH1YLR223C 3258 nt0.83□□□□□ -2.28
CPD1P53314 YDL073WYDL073W 2955 nt0.82□□□□□ -2.28
CPD1P53314 RIM20YOR275C 1986 nt0.81□□□□□ -2.28
CPD1P53314 MRPL50YNR022C 420 nt0.81□□□□□ -2.28
CPD1P53314 PRP16YKR086W 3216 nt0.8□□□□□ -2.28
CPD1P53314 YAR009CYAR009C 3591 nt0.8□□□□□ -2.28
CPD1P53314 BUD3YCL014W 4911 nt0.79□□□□□ -2.28
CPD1P53314 snR72snR72 98 nt0.79□□□□□ -2.28
CPD1P53314 YDL196WYDL196W 330 nt0.79□□□□□ -2.28
CPD1P53314 GPG1YGL121C 381 nt0.79□□□□□ -2.28
CPD1P53314 snR51snR51 107 nt0.79□□□□□ -2.28
CPD1P53314 WAR1YML076C 2835 nt0.79□□□□□ -2.28
CPD1P53314 RAD34YDR314C 2079 nt0.79□□□□□ -2.28
CPD1P53314 YAP6YDR259C 1152 nt0.78□□□□□ -2.28
CPD1P53314 SDH7YDR511W 402 nt0.78□□□□□ -2.28
CPD1P53314 YGR042WYGR042W 816 nt0.78□□□□□ -2.28
CPD1P53314 YHL042WYHL042W 453 nt0.78□□□□□ -2.28
CPD1P53314 YKL083WYKL083W 615 nt0.77□□□□□ -2.29
CPD1P53314 SMC1YFL008W 3678 nt0.76□□□□□ -2.29
CPD1P53314 YIR044CYIR044C 186 nt0.76□□□□□ -2.29
CPD1P53314 YAR047CYAR047C 321 nt0.76□□□□□ -2.29
CPD1P53314 INP2YMR163C 2118 nt0.76□□□□□ -2.29
CPD1P53314 PKH2YOL100W 3246 nt0.75□□□□□ -2.29
CPD1P53314 YHL041WYHL041W 450 nt0.75□□□□□ -2.29
CPD1P53314 YNL058CYNL058C 951 nt0.75□□□□□ -2.29
CPD1P53314 YPR117WYPR117W 7470 nt0.75□□□□□ -2.29
CPD1P53314 RPS24BYIL069C 408 nt0.74□□□□□ -2.29
CPD1P53314 RPL26AYLR344W 384 nt0.74□□□□□ -2.29
CPD1P53314 ISF1YMR081C 1017 nt0.74□□□□□ -2.29
CPD1P53314 ATG31YDR022C 591 nt0.73□□□□□ -2.29
CPD1P53314 ISD11YER048W-A 285 nt0.73□□□□□ -2.29
CPD1P53314 PCF11YDR228C 1881 nt0.73□□□□□ -2.29
CPD1P53314 PAC1YOR269W 1485 nt0.73□□□□□ -2.29
CPD1P53314 SWF1YDR126W 1011 nt0.72□□□□□ -2.29
CPD1P53314 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.72□□□□□ -2.29
CPD1P53314 PAU24YBR301W 363 nt0.72□□□□□ -2.29
CPD1P53314 NIP100YPL174C 2607 nt0.72□□□□□ -2.29
CPD1P53314 CUL3YGR003W 2235 nt0.71□□□□□ -2.3
CPD1P53314 RPS20YHL015W 366 nt0.71□□□□□ -2.3
CPD1P53314 YJL007CYJL007C 315 nt0.71□□□□□ -2.3
CPD1P53314 DBP6YNR038W 1890 nt0.7□□□□□ -2.3
CPD1P53314 ALG13YGL047W 609 nt0.69□□□□□ -2.3
CPD1P53314 MAM33YIL070C 801 nt0.68□□□□□ -2.3
CPD1P53314 PAM16YJL104W 450 nt0.68□□□□□ -2.3
CPD1P53314 RPL38YLR325C 237 nt0.68□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 118 ms