Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GBX2P52951 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX2P52951 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GBX2P52951 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GBX2P52951 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms