Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LHX2P50458 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LHX2P50458 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LHX2P50458 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LHX2P50458 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LHX2P50458 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms