Protein–RNA interactions for Protein: P47914

RPL29, 60S ribosomal protein L29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL29P47914 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RPL29P47914 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL29P47914 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL29P47914 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL29P47914 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL29P47914 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms