Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
ITGAEP38570 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ITGAEP38570 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms