Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HOXD12P35452 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms