Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTNNB1P35222 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms