Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NTF4P34130 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF4P34130 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF4P34130 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF4P34130 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF4P34130 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF4P34130 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF4P34130 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF4P34130 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF4P34130 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF4P34130 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms