Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

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Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COL4A5P29400 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
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