Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms