Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARK3P27448 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARK3P27448 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MARK3P27448 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MARK3P27448 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARK3P27448 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARK3P27448 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARK3P27448 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARK3P27448 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms