Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HMGB2P26583 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HMGB2P26583 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms