Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA2P25787 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA2P25787 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA2P25787 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMA2P25787 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA2P25787 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms