Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
VAMP1P23763 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms