Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NTF3P20783 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF3P20783 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF3P20783 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NTF3P20783 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms