Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCFC2P16383 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GCFC2P16383 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms