Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXB1P14653 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms