Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKCSHP14314 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms