Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT1P13805 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT1P13805 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms