Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCL5P13501 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCL5P13501 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCL5P13501 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL5P13501 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL5P13501 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL5P13501 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL5P13501 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL5P13501 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL5P13501 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCL5P13501 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCL5P13501 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCL5P13501 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCL5P13501 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms