Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PYGBP11216 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PYGBP11216 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PYGBP11216 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PYGBP11216 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PYGBP11216 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PYGBP11216 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PYGBP11216 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PYGBP11216 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PYGBP11216 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PYGBP11216 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PYGBP11216 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PYGBP11216 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms