Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LAMC1P11047 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LAMC1P11047 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
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