Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TMEM225BP0DP42 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TMEM225BP0DP42 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms