Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
C8orf88P0DMB2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms