Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TPM2P07951 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TPM2P07951 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPM2P07951 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPM2P07951 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms