Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN3P07498 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN3P07498 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CSN3P07498 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CSN3P07498 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSN3P07498 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms