Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HBE1P02100 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HBE1P02100 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms