Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGHV3-9P01782 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV3-9P01782 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms