Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SYF2O95926 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SYF2O95926 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SYF2O95926 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SYF2O95926 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SYF2O95926 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms