Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DDX58O95786 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DDX58O95786 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX58O95786 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX58O95786 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX58O95786 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DDX58O95786 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX58O95786 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX58O95786 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX58O95786 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX58O95786 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX58O95786 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX58O95786 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DDX58O95786 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DDX58O95786 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DDX58O95786 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms