Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFL1O94874 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFL1O94874 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFL1O94874 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFL1O94874 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFL1O94874 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFL1O94874 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UFL1O94874 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UFL1O94874 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UFL1O94874 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UFL1O94874 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UFL1O94874 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UFL1O94874 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFL1O94874 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFL1O94874 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFL1O94874 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFL1O94874 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFL1O94874 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UFL1O94874 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFL1O94874 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UFL1O94874 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UFL1O94874 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UFL1O94874 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFL1O94874 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFL1O94874 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFL1O94874 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFL1O94874 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFL1O94874 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFL1O94874 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFL1O94874 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFL1O94874 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UFL1O94874 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UFL1O94874 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms