Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBBP9O75884 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms