Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSO75390 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSO75390 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSO75390 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CSO75390 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CSO75390 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSO75390 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSO75390 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CSO75390 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSO75390 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSO75390 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSO75390 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSO75390 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSO75390 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CSO75390 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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