Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PPFIA2O75334 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PPFIA2O75334 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms