Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGSF3O75054 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGSF3O75054 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms