Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRD4O60885 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRD4O60885 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRD4O60885 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRD4O60885 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRD4O60885 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRD4O60885 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms