Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DENRO43583 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DENRO43583 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DENRO43583 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DENRO43583 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DENRO43583 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DENRO43583 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DENRO43583 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DENRO43583 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DENRO43583 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DENRO43583 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DENRO43583 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DENRO43583 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DENRO43583 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DENRO43583 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DENRO43583 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms