Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC27A2O14975 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC27A2O14975 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms