Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PEX7O00628 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PEX7O00628 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX7O00628 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms