Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYSRT1A8MQ03 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms