Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TTLL13PA6NNM8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL13PA6NNM8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL13PA6NNM8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL13PA6NNM8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL13PA6NNM8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL13PA6NNM8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TTLL13PA6NNM8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms