Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC85CA6NKD9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC85CA6NKD9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms